Por otra parte, la elaboración de los expedientes de los sitios arqueológicos tiene por finalidad generar y resguardar bajo decreto ministerial los polígonos arqueológicos; así como delimitar zonas de interés, tanto la zona 1 de Máxima protección, y la zona 2 correspondiente a la zona de amortiguamiento, lo que servirá como herramienta a los gobiernos locales para generar las ordenanzas de uso y manejo de suelo.
Se ha realizado los expedientes de los Sitios: Pumapungo y Todo Santos, Cojitambo, Ingapirca, y están en proceso de elaboración y revisión los expedientes de: Paredones de Culebrillas, Chobshi, Paredones de Molleturo, y El Remanso.
Las prioridades actuales:
- Monitoreo Del Estado De Conservación Del Qhapaq Ñan, Tramos Subtramos, Secciones Y Sitios Asociados.
- Elaboración del expediente de delimitación del sitio arqueológico Paredones de Culebrillas (ejecutado y en revisión).
- Elaboración del expediente de delimitación del sitio arqueológico Chobshi (ejecutado y corrigiendo).
- Elaboración del expediente de delimitación del sitio arqueológico Paredones de Molleturo (en Ejecución).
- Elaboración del expediente de delimitación del sitio arqueológico El Remanso (Por ejecutar).