El Instituto Nacional de Patrimonio Cultural, como responsable de la investigación, gestión y control técnico del patrimonio arqueológico a nivel nacional, cuenta con la Dirección de Áreas Arqueológicas, Paleontológicas y el Patrimonio Subacuático en su sede matriz, con dos Centros de Investigación e Innovación ubicados en las provincias de Manabí y Cañar y con Unidades de Arqueología en sus sedes desconcentradas a fin de:

• Administrar el Sistema Ecuatoriano de Áreas Arqueológicas y Paleontológicas
• Implementar planes, programas y proyectos de investigación
• Determinar la viabilidad de propuestas externas de investigación
• Supervisar la administración de los museos de sitio
• Realizar el control técnico de los sitios y áreas arqueológicas y paleontológicas
• Realizar el inventario del patrimonio cultural arqueológico
• Gestionar la reserva técnica de investigación de bienes arqueológicos y/o paleontológicos
• Autorizar la salida de muestras o fragmentos con fines de investigación
• Delimitar los polígonos de protección de Áreas Arqueológicas
• Autorizar intervenciones de sitios arqueológicos
• Brindar asesoría técnica especializada, entre otros

Principales servicios:

• Autorización para investigaciones arqueológicas o paleontológicas
• Autorización de propuestas técnicas para intervenciones de sitios arqueológicos
• Certificaciones de inventario de sitios arqueológicos
• Certificaciones de No afectación patrimonial
• Autorización de salida de fragmentos/muestras con fines de investigación
• Registro de transferencia de dominio de terrenos en los que se encuentran sitios arqueológicos
• Registro de profesionales en arqueología